H κλήρωση του Conference League για τον Β προκριματικό γύρο έγινε γνωστή, με την ΑΕΚ και τον Άρη να μαθαίνουν τους αντιπάλους τους. Συγκεκριμένα η Ένωση θα αντιμετωπίσει το νικητή του ζευγαριού Βελέζ Μόσταρ/ Κολερέιν, ενώ από την πλευρά του ο Άρης θα κοντραριστεί με την Αστάνα από το Καζακστάν.
Ωστόσο πέρα από τις Ελληνικές ομάδες υπήρξε η κλήρωση και για άλλες ομάδες με τα ζευγάρια να είναι τα παρακάτω: